Sonderzeichen

Du hast Recht: wenn immer der gleiche Weg mit den gleichen Einstellungen eingeschlagen wird, sollte auch ein berechenbares Ergebnis herauskommen.
Nur siehst du ja selbst, dass die Ergebnisse nicht immer gleich sind.
Und wenn du der Ursache auf den Grund kommen willst (ob es an den Tag-Daten liegt oder doch an was anderem), dann kannst du mit MP3tag eben die Tag-Daten überprüfen - nichts anderes schlage ich dir vor.
Die Idee, dass es da irgendwo einen Bug geben kann, solltest du noch ein bisschen ausführen: bei wem vermutest du den Bug? MP3tag zeigt doch alle Tags richtig an, oder?
Und zu dem Problem, dass die Zeichenkodierung nicht von allen Programmen gleich flexibel gehandhabt wird, gibt es einen, sogar schon etwas abgehangenen Beitrag von 2006: /t/2786/1

Mein Vorschlag lautet: guck dir die Zeichenkodierung an von 2 Dateien, einer, die geht und einer, wo es nicht geht.
Wenn es keine Unterschiede gibt, war das wohl nicht die Ursache. Aber theoretisch und aus der Ferne die Annahme zu diskutieren, dass alles gleich sein müsste, bringt uns überhaupt nicht weiter.