Ein Vorschlag:
An alle Namen der vorhandenen Bilddateien (*.jpg, *.png, *.gif etc.) die Endung .mp3 anhängen.
Mp3tag kann diese Dateien dann sehen und zusammen mit den normalen mp3 Dateien verschieben.
Hinterher muss man dann alle diese besonderen Namen der Bilddateien wieder auf den Originalzustand zurückändern.
Das Umbenennen ließe sich durch Kommandozeilen Stapeldateien erledigen, die über Exportskripte von Mp3tag erzeugt werden.
Beispiel:
Umbenennen von "cover.jpg" nach "$.cover.jpg.mp3".
Schreibschutzattribut beachten (entfernen).
Mit Mp3tag verschieben.
Umbenennen von "$.cover.jpg.mp3" nach "cover.jpg".
DD.20080329.1530.CET