Meiner Ansicht nach müsstest erst mal klären, ob die gain-Information destruktiv oder deskriptiv angewandt wurde.
Siehe auch diesen Thread:
... und das heißt: du müsstest dich beim Support deines Programms informieren, welche Folgen ein Löschen dieser Tag-Felder hat.
MP3tag kümmert sich nur um den Metadaten-Teil, welche Auswirkungen das auf den Nutzdatenteil einer Datei hat, ist nicht Sache von MP3tag.