Hallo eos,
das Entfernen der ID3v2-Tags dürfte meiner Meinung nach bei den heutigen Decodern keine Probleme bereiten.
Falls danach die Bitrate oder die Länge Deiner Dateien in manchen Programmen dennoch falsch angezeigt werden sollte, kannst Du den VBR-Header wie in diesem Beitrag beschrieben wieder reparieren.
Viele Grüße,
~ Florian