Hallo Nevyn,
kann eigentlich nicht sein, da MP3tag nicht auf eine bestimmte Anzahl begrenzt ist. Schau mal nach, ob du auch das einlesen der Unterverzeichnisse aktiviert hast oder eventuell diverse defekte Dateien im Verzeichnis hast. Ansonsten empfehle ich Dir die aktuelle Version zu laden. Du kannst auch hier: /t/1148/1 nochmal nachsehen, da ging es ebenfalls um das Thema. So was kann man aber auch über die Forum- Suche finden.
Sollte es für Dich nicht zu lösen sein, poste mal Deine Version und die Verzeichnisstruktur!
Gruß,
Werner